Die Benutzeroberfläche ähnelt zwar einem Web-Browser. Ein Zugriff via Web-Client ist aber nicht möglich. Der linke Fensterabschnitt enthält eine Navigationsleiste für Funktionen. Das Hauptfenster zeigt die zum jeweiligen Menüpunkt gehörenden Befehlsoptionen sowie in zwei Unterfenstern weiter Informationen an. Durch die Vielzahl der Fenster ist die Navigation unübersichtlich. Zudem ist nicht immer klar, welche Funktionen sich hinter welchen Menüs verbergen.

Bevor HF Netchk Pro einen Scan startet, lädt die Software zunächst die aktuellen Patch-Informationen von der Shavlik-Webseite herunter. Im Test funktionierte dies tadellos. Shavlik stellt hierfür XML-Dateien auf seiner Web-Seite bereit und ergänzt diese umgehend, sobald Microsoft neue Hotfixes veröffentlicht hat. Spezialisten von Shavlik testen die Patches, bevor sie in die XML-Datei aufgenommen werden. Bei jedem Scan-Vorgang verbindet sich HF Netchk Pro zunächst mit dieser Site und bezieht die aktuellen XML-Files.

Shavlik hat das Patch-Tool mit dem Active Directory integriert. Für einen Scan lässt sich entweder ein Rechner, eine gesamte Domäne, eine Computer-OU oder eine individuell erstellte Computergruppe auswählen. Der Administrator kann die IP-Adressen und Namen zudem aus einer Datei importieren.

HF Netchk Pro unterscheidet drei Scan-Arten. Der "Quick Scan" führt keine Checksummen-Prüfung der Dateien durch, sondern sucht wie der "Full Scan" nur nach Security-Updates. Der "Windows-Update-Scan" umfasst dagegen alle Anwendungen, die HF Netchk Pro unterstützt. Über Zeitplaner bestimmt der Verwalter den Zeitpunkt für die Scans.

Die Scan-Ergebnisse stellt HF Netchk Pro auf unterschiedliche Weise dar. Die Zusammenfassung gewährt einen Überblick des Gesamtbefunds. In der Detailansicht zeigt das Tool die Ergebnisse für jeden Rechner einzeln an. Mit Hilfe von Templates und Filterfunktionen ist es möglich, einen Scan von vornherein auf bestimmte Anwendungen oder Patches zu begrenzen.

Die Standard-Reports von HF Netchk Pro liefern maßgeschneiderte Information über den Patch-Zustand eines Rechners oder einer Gruppe. Der Administrator kann zwischen 23 Berichten wählen. Dabei stehen mehrere Filterfunktionen zur Verfügung. Die Reports lassen sich auch in andere Dateiformate exportieren.