Die kaufmännische Software des Saarbrücker Unternehmens unterstützt nun auch mehrstufige HBCI-Verfahren wie „iTAN“, „mTAN“ und „SmartTAN Plus“, mit denen Banken die Daten ihrer Kunden schützen. Diese Systeme werden von immer mehr Kreditinstituten eingeführt. Während beim iTAN-Verfahren eine bestimmte, indizierte TAN auf einer Liste abgefragt wird, wird beim mTAN die TAN für die jeweilige Transaktion nicht über das Online-Banking sondern per SMS auf das Handy des Kunden übertragen. Beim SmartTAN Plus wird die TAN über ein spezielles Kartenlesegerät individuell für jede Transaktion beim Kunden zu Hause erzeugt.

Die Programme von Collmex verfügen über eine Schnittstelle zum Online-Banking und ermöglichen dadurch, Überweisungen und Lastschriften direkt aus der Buchhaltung heraus im Sammelverfahren zu initiieren. Zudem können Kontoauszüge abgeholt und in die Buchführung importiert werden. Betrag und Belegtext des jeweiligen Vorgangs werden vom Programm selbstständig aus dem Kontoauszug entnommen und zur Buchung vorgeschlagen. Die Kontierung ermittelt das Programm automatisch aus zuvor gebuchten Umsätzen. Die Aktualisierung der Anwendungen erfolgte für die Anwender dank des OnDemand-Modells automatisch, ohne dass dazu eigene Schritte der User erforderlich waren.