Die wichtigsten Änderungen gegenüber Version 3 sind ein neuer WDDM-Treiber, der zusammen mit Backend-Änderungen bis zu 80 Prozent höhere 3D- und Videoleistung bringen soll, volle Unterstützung für Ubuntu 9.10 "Karmic Koala" 32 und 64 Bit (zumindest so lange man unter "volle" nicht Compiz-Desktop-Effekte versteht), ein 64-bittiges Netz-Subsystem (die Core Engine war bereits 64-bittig ausgelegt), Import von Standalone-VHDs und virtuellen Maschinen aus dem Konkurrenzprodukt Parallels Desktop 5 sowie last, but not least verringerte Resume-Zeiten für Virtuelle Maschinen.

Außerdem haben die VMware-Entwickler mehr als 50 Bugs beseitigt, beispielsweise beim Upgrade der VMware Tools aus der Vorversion 2.0.5 oder mit "exzessiven" Spotlight-Suchen nach virtuellen Maschinen bei im Hintergrund geöffneter VM-Bibiliothek. Details zu den Korrekturen finden Interessierte in den Release Notes. VMware Fusion 3.0.1 kann über die integrierte Softwareaktualisierung sowie einzeln heruntergeladen werden.